El alcalde de Pamplona, Joseba Asiron, suscribió a mediados de septiembre el Decreto de Alcaldía que establece la organización municipal. La Administración se estructura en ocho grandes unidades orgánicas, una dependiente directamente del alcalde y las otras siete como concejalías delegadas. La Ley Reguladora de las Bases del Régimen Local atribuye al alcalde la potestad de establecer la organización y estructura de la administración municipal ejecutiva.
El decreto señala que "fundamentalmente, se reduce el número de áreas de gobierno, de tal manera que donde había ocho áreas más la Gerencia y el gabinete de Alcaldía que representan en realidad otras dos áreas más, ahora se aprueba que el gobierno municipal se ejerza mediante ocho áreas y, como consecuencia, se agrupan y trasladan competencias". Esas ocho grandes unidades orgánicas serán el área de Gobierno Transparente, que depende directamente del alcalde; Economía Local Sostenible; Acción Social y Desarrollo Comunitario; Seguridad Ciudadana y Convivencia; Cultura, Política Lingüística, Educación y Deporte; Ciudad Habitable y Vivienda, Ecología Urbana y Movilidad; y Participación Ciudadana, Igualdad y Empoderamiento Social. Cada unidad dispondrá al menos de una dirección y una secretaría técnica. No obstante, varias áreas podrán compartir una misma secretaría técnica, como en el caso del área de Gobierno Transparente que dispondrá indistintamente de las secretarías técnicas asignadas al área de Economía Local Sostenible. Precisamente, Economía Local Sostenible y de Ciudad Habitable y Vivienda tendrán dos direcciones cada una. Economía Local Sostenible acogerá Recursos Humanos y Hacienda, Comercio y Turismo. Por su parte, Ciudad Habitable y Vivienda contará con las direcciones de Urbanismo y Vivienda, y de Conservación Urbana y Proyectos. Se crea, además, una concejalía especial de Igualdad.
En cuanto a las empresas y organismos municipales, Mercairuña y Comiruña dependerán del área de Economía Local Sostenible; Escuelas Infantiles y la Fundación Teatro Gayarre de Cultura, Política Lingüística, Educación y Deporte; la Oficina de Rehabilitación, Gerencia de Urbanismo y Pamplona Centro Histórico, de Ciudad Habitable y Vivienda; ASIMEC estará adscrita a Acción Social y Desarrollo Comunitario; y la Agencia Energética Municipal a Ecología Urbana y Movilidad.